Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RUFY3Q7L099 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUFY3Q7L099 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms