Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00336Q6ZUF6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00336Q6ZUF6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms