Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CFAP47Q6ZTR5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CFAP47Q6ZTR5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms