Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM43BQ6ZT52 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM43BQ6ZT52 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM43BQ6ZT52 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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