Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC55Q6ZSA7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC55Q6ZSA7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC55Q6ZSA7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms