Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
C9orf47Q6ZRZ4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms