Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM72Q6ZMU5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM72Q6ZMU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms