Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MUC6Q6W4X9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MUC6Q6W4X9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms