Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PACS1Q6VY07 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACS1Q6VY07 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACS1Q6VY07 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms