Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LINGO4Q6UY18 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO4Q6UY18 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO4Q6UY18 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms