Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP8

SBSN, Suprabasin, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBSNQ6UWP8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SBSNQ6UWP8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SBSNQ6UWP8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SBSNQ6UWP8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SBSNQ6UWP8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBSNQ6UWP8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SBSNQ6UWP8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms