Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO38Q6PIJ6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO38Q6PIJ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms