Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC174Q6PII3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC174Q6PII3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC174Q6PII3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms