Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF06

TRMT10B, tRNA methyltransferase 10 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT10BQ6PF06 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRMT10BQ6PF06 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRMT10BQ6PF06 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms