Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IRGCQ6NXR0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRGCQ6NXR0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms