Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF40BQ6NWY9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF40BQ6NWY9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF40BQ6NWY9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms