Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRAMD4Q6IC98 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRAMD4Q6IC98 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRAMD4Q6IC98 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms