Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RALGAPA1Q6GYQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RALGAPA1Q6GYQ0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms