Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTRHD1Q6GMV3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTRHD1Q6GMV3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms