Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A4Q6AI14 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms