Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L1Q676U5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG16L1Q676U5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG16L1Q676U5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264 ms