Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG9BQ674R7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG9BQ674R7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms