Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FOCADQ5VW36 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOCADQ5VW36 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOCADQ5VW36 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms