Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATRNL1Q5VV63 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATRNL1Q5VV63 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATRNL1Q5VV63 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms