Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC38Q5VT99 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC38Q5VT99 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC38Q5VT99 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms