Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
L1TD1Q5T7N2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1TD1Q5T7N2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms