Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NUP188Q5SRE5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NUP188Q5SRE5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NUP188Q5SRE5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms