Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO47Q5MNV8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO47Q5MNV8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO47Q5MNV8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms