Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC158Q5M9N0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC158Q5M9N0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC158Q5M9N0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms