Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITRM1Q5JRX3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITRM1Q5JRX3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms