Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM4

ZNF542P, Putative zinc finger protein 542, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF542PQ5EBM4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF542PQ5EBM4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF542PQ5EBM4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF542PQ5EBM4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms