Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NCBP3Q53F19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NCBP3Q53F19 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCBP3Q53F19 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms