Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SBK1Q52WX2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBK1Q52WX2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms