Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C4orf46Q504U0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C4orf46Q504U0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms