Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC38Q502W7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC38Q502W7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC38Q502W7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms