Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPRNQ4KMQ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TPRNQ4KMQ1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
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