Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf22Q49AR2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C5orf22Q49AR2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C5orf22Q49AR2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms