Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LONRF3Q496Y0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LONRF3Q496Y0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms