Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC01559Q495D7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01559Q495D7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms