Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP41Q3LFD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP41Q3LFD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms