Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UVSSAQ2YD98 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UVSSAQ2YD98 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms