Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FHOD3Q2V2M9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC36■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
FHOD3Q2V2M9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
FHOD3Q2V2M9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms