Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTC1Q2NKJ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTC1Q2NKJ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTC1Q2NKJ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms