Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MSMPQ1L6U9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MSMPQ1L6U9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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