Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC142Q17RM4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC142Q17RM4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC142Q17RM4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
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