Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IMPG1Q17R60 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IMPG1Q17R60 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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