Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187BQ17R55 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM187BQ17R55 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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