Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMA3Q16787 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LAMA3Q16787 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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