Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGISQ16647 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTGISQ16647 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms