Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF9Q16594 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TAF9Q16594 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms